Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms