Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP98

C16orf47, Putative uncharacterized protein C16orf47, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf47Q6ZP98 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C16orf47Q6ZP98 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms