Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC137Q6PK04 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms