Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMBOX1Q6NT76 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMBOX1Q6NT76 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms