Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTC19Q6DKK2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTC19Q6DKK2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms