Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFI1BQ5VTD9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms