Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRIP1Q5VSL9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms