Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC158Q5M9N0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms