Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ESCO2Q56NI9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESCO2Q56NI9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms