Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC92Q53HC0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms