Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms