Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms