Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf46Q504U0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms