Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF212Q495C1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms