Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTLL9Q3SXZ7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms