Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRFIP1Q32MZ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRFIP1Q32MZ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms