Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC27Q2M243 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC27Q2M243 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms