Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
QSER1Q2KHR3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms