Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms