Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL8BQ17RB0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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