Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME3Q16798 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ME3Q16798 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME3Q16798 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME3Q16798 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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