Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPE65Q16518 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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