Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TNXAQ16473 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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