Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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