Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX1Q16384 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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SSX1Q16384 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SSX1Q16384 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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