Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms