Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECTIN1Q15223 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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