Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms