Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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