Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
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