Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHROOM2Q13796 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
SHROOM2Q13796 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
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