Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTCH1Q13635 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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