Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4BQ13620 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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