Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDGQ13569 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDGQ13569 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDGQ13569 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDGQ13569 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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