Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRPF4BQ13523 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF4BQ13523 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms