Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGADQ13349 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGADQ13349 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms