Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLN3Q13286 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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