Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALCOCO2Q13137 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CALCOCO2Q13137 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CALCOCO2Q13137 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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