Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RESTQ13127 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RESTQ13127 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RESTQ13127 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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