Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAF1AQ13111 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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