Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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IFT88Q13099 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT88Q13099 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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