Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFX1Q12986 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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