Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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