Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STX4Q12846 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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STX4Q12846 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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