Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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