Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms