Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPOCK1Q08629 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms