Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FMODQ06828 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FMODQ06828 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FMODQ06828 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FMODQ06828 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms