Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBXN1Q04323 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms