Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAV1Q03135 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms